Opis przypadku izolacji i wstępnej charakterystyki bakterii Escherichia albertii oraz Kosakonia cowanii z owoców cytrusowych

Świeże owoce mogą zostać zanieczyszczone mikroorganizmami na różnych etapach: podczas uprawy, zbioru i późniejszego obrotu. Źródłami bakterii bywają gleba, woda używana do nawadniania, nawozy organiczne, zwierzęta, owady oraz kontakt z ludźmi. Ponieważ owoce często spożywa się bez obróbki cieplnej, znaczenie ma ograniczanie zanieczyszczeń już w miejscu produkcji. Autorzy analizowali sześć limonek Rangpur (Citrus × limonia) pochodzących z dwóch drzew rosnących na gospodarstwie w okolicach São Paulo. Owoce połączono w jedną próbę i badano przede wszystkim pod kątem obecności bakterii kwasu mlekowego. Trzy wyizolowane bakterie Gram-ujemne nie pasowały jednak do profilu poszukiwanych drobnoustrojów, dlatego poddano je dalszym analizom.

Identyfikacja trzech izolatów

Na podstawie cech fizjologicznych, analizy rep-PCR i sekwencjonowania genu 16S rRNA jeden izolat oznaczono jako E. albertii, a dwa jako K. cowanii. Obydwa gatunki mogą sprawiać trudności w rutynowej identyfikacji, ponieważ są podobne do innych pałeczek jelitowych.

1. albertii jest bakterią opisywaną w związku z zakażeniami przewodu pokarmowego i występującą m.in. u ptaków. K. cowanii uważa się przede wszystkim za bakterię środowiskową i patogen roślin, choć opisywano ją także w zakażeniach oportunistycznych u ludzi. Autorzy nie ustalili źródła badanych izolatów. Bliskość hodowli drobiu potraktowali jako możliwe, lecz niepotwierdzone wyjaśnienie ich obecności na owocach.

Cechy wymagające dalszej oceny

Badane izolaty wykazywały aktywność β-galaktozydazy i żelatynazy oraz zróżnicowaną aktywność hemolityczną. W analizie PCR wykryto geny związane z wytwarzaniem fimbrii i hemolizyny. Nie stwierdzono natomiast sześciu innych badanych genów uznawanych za klasyczne markery zjadliwości, w tym genu eae kodującego intiminy.

Wszystkie izolaty były oporne na ampicylinę i wykazywały pośrednią wrażliwość na kwas nalidyksowy. Były natomiast wrażliwe na część pozostałych antybiotyków, m.in. gentamycynę i tetracyklinę. Test przesiewowy wskazał także na aktywność enzymów uczestniczących w przemianach aminokwasów, które w określonych warunkach mogą prowadzić do powstawania amin biogennych. Nie jest to jednak równoznaczne z wykryciem tych związków w limonkach. Autorzy zaznaczają, że wymagałoby to bezpośrednich oznaczeń chemicznych w odpowiedniej matrycy żywnościowej.

Podsumowanie

Badanie dotyczyło tylko trzech izolatów uzyskanych z jednej połączonej próbki owoców. Nie pozwala więc stwierdzić, jak często bakterie te występują na limonkach ani ocenić rzeczywistego ryzyka dla konsumentów. Dodatkowo sami autorzy wskazują, że identyfikację opartą na genie 16S rRNA warto w przyszłości potwierdzić metodami o większej rozdzielczości, np. sekwencjonowaniem całego genomu. Praca przypomina, że mikrobiologiczna ocena świeżych owoców powinna obejmować również izolaty nietypowe dla pierwotnego celu badania.

Źródło: https://www.mdpi.com/2036-7481/17/10/192#