Nowa baza danych mikroorganizmów obecnych w żywności

Na podstawie analizy setek produktów spożywczych międzynarodowy zespół naukowców stworzył bazę danych dotyczących drobnoustrojów występujących w żywności. Opis badań opublikowano niedawno w prestiżowym czasopiśmie Cell.

Największe tego typu badanie w historii

Curated Food Metagenomic Database (CFMD) jest wynikiem największego przeprowadzonego do tej pory badania nad mikroorganizmami obecnymi w żywności. Dane zawarte w bazie pozwolą na identyfikację i kontrolę patogenów, monitorowanie występowania drobnoustrojów na różnych etapach łańcucha żywnościowego, obserwację rozpowszechniania genów odpowiadających za antybiotykooporność, a także na poprawę właściwości probiotycznych produktów spożywczych.

Dane z 50 krajów

CFMD powstała w ramach pracy międzynarodowego konsorcjum MASTER, które przeanalizowało ponad 2500 metagenomów – definiowanych jako całość materiału genetycznego mikroorganizmów występujących w danym środowisku – związanych z produktami spożywczymi pochodzącymi z 50 krajów. Aż 1950 z nich zostało zsekwencjonowanych po raz pierwszy. Naukowcy zidentyfikowali 10 899 mikroorganizmów powiązanych z analizowanymi produktami, z których połowa była do tej pory nieznana. Jak się okazało, drobnoustroje te odpowiadają za 3% składu mikrobioty jelitowej osób dorosłych i aż 56% składu mikrobioty dzieci.

Wpływ na produkcję, trwałość i bezpieczeństwo żywności

„Mikroorganizmy występujące w żywności mogą mieć pozytywny bądź negatywny wpływ na proces jej produkcji, a także na jej trwałości oraz przenoszenie potencjalnych chorób”, mówi jeden z autorów publikacji, dr Abelardo Margolles z Hiszpańskiej Wyższej Rady Badań Naukowych. „Tradycyjnie drobnoustroje z produktów spożywczych analizowano poprzez posiewy na podłożach mikrobiologicznych w szalkach, jednak proces ten jest powolny i nie nadaje się do hodowli wszystkich rodzajów mikroorganizmów”, w przeciwieństwie do nowoczesnych technik genomowych.

„Kamień milowy w rozwoju mikrobiologii żywności”

CFMD „stanowi kamień milowy w rozwoju mikrobiologii żywności”, podkreśla hiszpański naukowiec. „Pozwoli ona ekspertom na zmierzenie się z wyzwaniami, które do tej pory przysparzały trudności ze względu na niewielką ilość informacji o metagenomach w żywności znajdujących się w dostępnych bazach danych”, podsumowuje dr Margolles.

Źródła:

1. https://www.cell.com/cell/fulltext/S0092-8674(24)00833-X
2. https://www.agenciasinc.es/Noticias/Una-base-de-datos-revela-que-hay-en-el-microbioma-de-los-alimentos-que-comemos